В верхней части эмблемы находится изображение шаттла, проводящего съемку поверхности Земли с помощью топографического радиолокатора по программе SRTM (Shuttle Radar Topography Mission), что являлось основной задачей полёта. Надпись, формулирующая задачу полёта - Earth Observation («Зондирование Земли») и номер миссии STS-99 видны в центральной части эмблемы.
Описание эмблемы - Леон Розенблюм